Moleküler Mikrobiyoloji Birimi bünyesinde çalışan dört laboratuvar mevcuttur. Bu laboratuvarlarda konvansiyonel ve moleküler mikrobiyoloji, seroloji, hücre kültürü çalışmaları için uygun alt yapı mevcuttur. Dolayısıyla mikrobiyal izolasyon, identifikasyon, kültür, moleküler tiplendirme, klonal yakınlık, apoptozis ve sitotoksisite, antijenite ile ilgili çalışmalar yapılabilmektedir.