Bu birim kronik hipoksi sonucu oluşan nöroplastisite ve ventilatuar aklimatizasyondaki fizyolojik mekanizmaların genetik ve moleküler sinyallerinin belirlenmesi üzerine çalışmaktadır. Araştırmalarımızda akut, aralıklı ve kronik hipoksi modelleri incelenmektedir. Özellikle kronik hipoksiye olan yatkınlık ve tolerans mekanizmalarında var olan, santral sinir sisteminde solunum kontrolünde etkili mikrosirkuisler üzerinde çalışılmaktadır. Hipoksi biriminde ayrıca hayvan modellerinde gaz değişim ölçümleri yapılmaktadır. Bu çalışmalar gaz değişimindeki limitasyonları (difüzyon limitasyonu, ventilasyon/ perfüzyon heterojenitesi), kan örneklemesi (noninvaziv ve invaziv arter kan gazı ölçümleri) ve karşılaştırmalı fizyoloji (insanlardaki gaz değişimi ve akciğer hastalıklarının hayvan modellemeleri) üzerine yoğunlaşmaktadır.