Proteomiks Birimi

Home Proteomiks Birimi

PROTEOM NEDİR?

Zaman, mekân, doku veya organizma düzeyinde proteinlerin yapı, fonksiyon ve etkileşimlerini inceleyen bilim dalına “proteomiks” denilmektedir. Proteom, genom tarafından sentezlenen peptit /protein tabanlı tüm gen ürünlerini kapsayan bir terim olup, genomun protein karşılığı olarak tanımlanmaktadır. Proteom, hücresel davranış ve fonksiyonları tanımlayan oldukça dinamik bir süreci ifade etmektedir. Proteinler hücre/organizmanın değişen içsel ve dışsal etkilere cevap olarak sürekli değişirler ve bu dinamik sürece ait kapsamlı bilgi ancak proteomik tekniklerle elde edilebilmektedir. Çeşitli uyaranlara (örneğin; parazitler/patojenler, sters, ilaç vb.) karşı geliştirilen cevabın incelenmesi, hastalık durumlarında ifade edilen ve biyomarker olarak kullanılabilecek proteinlerin belirlenmesi gibi reel durumlarda protein ekspresyon haritalarının oluşturulması sağlamaktadır. Protein-protein ilişkilerini çalışılması amacı ile de bu teknik yaygın şekilde tercih edilmektedir. Birbiri ile etkileşim halindeki proteinlerin belirlenmesi ile hücre içi ağda yer alan birçok süreç ve yolağın ortaya çıkarılması bu proteomik’in çıktıları arasında yer almaktadır. Ayrıca, immünoproteom teknolojisi, serolojik tekniklerle birlikte kullanılması kanser araştırmalarında tümöre özgül otoantijenlerin belirlenmesi, enfeksiyon hastalıkları ve patojenlerle ilgili araştırmalarda ise virulans faktörlerinin, antijenlerin, aşı ve ilaç adaylarının belirlenmesi, tanıya ve hastalığın seyrinin takibine olanak verecek marker keşfini/geliştirilmesini sağlamaktadır.

Proteomiksin araştırma konuları:

  • Proteinlerin ne zaman ve nerede ifade edildiği
  • Protein üretin oranı, yıkımı, stabil kalma oranı
  • Proteinlerin nasıl modifiye edildiği (post-translasyonal modifikasyonlar (PTM); fosforilasyon)
  • Proteinlerin hücre içi organellerde geçişi ve yer değişimi
  • Proteinlerin metabolik yolaklarla ilintisi
  • Proteinlerin birbiri ile ilintisi/etkileşimi
  • İmmünoproteom teknikleri ile aşı geliştirilmesi
  • Antikor karakaterizasyonu ve biyo-benzer IgG karakterizasyonu ve validasyonu

Proteomiks birçok biyolojik problemin çözümünde/açıklanabilmesinde önemli katkılar sağlar; bunlardan bazıları:

  • Proteinlerin hangi proteinlerle spesifik etkileşim halinde olduğunu (örneğin, tümör baskılayıcı protein p53)
  • Hücre içi organellerde sınırlı/görevli proteinler (subcellular lokalizyon; mitokondri)
  • Hangi proteinlerin biyolojik süreçler içinde yer aldığı (örneğin, yaşlanma)
  • Hangi proteinler sıcak/soğuk, tuz veya parazit gibi dışsal streslere karşı cevap vermede görev aldığı
  • Hangi proteinlerin mutasyonlardan etkilenir veya mutasyonal mekanizmalarda yol aldığı gibi.

Proteomiks çalışmalarda özünde yüksek verimli esasına dayalı, gelişmiş teknolojik enstrimantasyonla yapılabilmektedir. Laboratuvar ortamlı çalışmaların devamında jel tabanlı veya sıvı kromotografik enstrümantasyonlar ile peptit kütle analizine gidilmektedir. Genel hatları bir sıvı kromatografi cihazının bir kütle spektrometrisi cihazına bağlanmasıyla oluşturulan bütünleşik cihazlara (LC-MS veya MALDI-TOF gibi) analizler gerçekleşmektedir. Doğası gereği yüksek verimli teknolojiler yüklü miktarda veri üretmektedirler. Bu verilerin analizinde araştırmacıların elde ettikleri sonuçlarla veritabanlarında mevcut bilgiler arasında bağlantı kurmayı ve analizi olası kılan biyoinformatik tabanlı yaklaşımlar esas alınmaktadır.

DSC03572 kopya

PROF. DR. SERVET ÖZCAN
PROTEOM BİRİM SORUMLUSU

E-Posta: ozcan@erciyes.edu.tr / servet3@gmail.com
0 352 4379315 (13615)
Adsız Tasarım Kopyası (2)
Dr. Mustafa Burak ACAR
Doktora Sonrası Araştırmacı

YÖK 100/2000 öncelikli alanlar doktora programında kapsamında 2020 yılında doktora derecesini almıştır. Doktora sırasında proteomik analizlerle kök hücre ve IPS’lerde yaşlanma genotoksik stres konularında araştırmalar yapmıştır.  Laboratuvarımızda yürütülmekte olan TÜBİTAK 1001 projesinde doktora sonrası araştırmacı olarak çalışmalarına devam etmektedir.

E-Posta: acarmburak@gmail.com

DSC03409 kopya
Zeynep GÜNAYDIN
Doktora Öğrencisi

Biyoloji lisans mezunu. Kök hücre bölümünde doktora eğitimine devam etmekte.

E-Posta: gunaydinzeyynep@gmail.com

Adsız tasarım (1)
Melis GÜZEL
Yüksek Lisans Öğrencisi

Biyoteknoloji lisans mezunu. Moleküler biyoloji ve genetik  bölümünde yüksek lisans eğitimine devam etmekte.

E-Posta: melais919@gmail.com

Birimde Aktif Olarak Yürütülen Çalışmalar
  1. B Hücreli Akut Lenfoblastik Lösemi (B-All) Yüzey Proteomunun Incelenerek Yeni Kimerik Antijen Reseptörü (Car) Hedeflerinin Belirlenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Ovalı E., Karakükcü M. , Ayaz Güner Ş., Acar M.B., Günaydın Z., Bolat M., Güzel M., Tübitak Projesi, 2019-Devam Ediyor
  2. Senesent Mezenkimal Kök Hücre Sekretomu İle Kültüre Edilmiş Lenfositlerin Meme Kanseri Hücre Hattı Üzerine Etkisinin Proteomik Yaklaşımlarla Değerlendirilmesi. Özcan S. (Yürütücü), Güzel M. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2022-Devam ediyor
  3. Senesent Mezenkimal Kök Hücre Sekretomunun SASP Meme Kanseri Hücre Hattı EMT Mekanizması Üzerine Etkisinin Değerlendirilmesi. Özcan S. (Yürütücü), Yıldır S. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2022-Devam ediyor
  4. Obez Fare Kaynaklı Mezenkimal Kök Hücrelerin Fare Pankreas Beta Hücre Hattı Min6 Üzerine Etkilerinin Araştırılması ÖZCAN S. (Yürütücü), ACAR M.B (Araştırmacı), DOSAP, 2022- Devam ediyor
  5. Senesent Mezenkimal Kök Hücre Hedeflenebilir Yüzey Belirteçlerinin Proteomik Yaklaşımla Belirlenmesi Acar M.B (Yürütücü), AYAZ Güner Ş. (Danışman) Özcan S., Aydın Ö., Güner H. Yıldırım V., Galderisi U., Tübitak Projesi, 2023 – Devam Ediyor
Birimde Tamamlanmış Çalışmalar
  1. Metformin Uygulanmış Senesent Mezenkimal Kök Hücre Sekretom Profilinin Proteomik Analizi Özcan S. (Yürütücü) , Karakükcü M. , Galderisi U. , Mert Gökduman E., Günaydın Z., Bozalan H. Tübitak Projesi, 2017 – 2020
  2. Ortodontik Tedavi Ve/Veya Periodontal Olarak Sıçan Dişlerinde Oluşturulan Dehisenslerin Tedavisinde Mezenkimal Kök Hücre Enjeksiyonu Ve Kollajen Aracılığı İle Mezenkimal Kök Hücre Aktarımı Uygulamasının Etkilerinin Değerlendirilmesi Ve Karşılaştırılması Gül Amuk N. (Yürütücü) , Kurt G., Özdamar S. , Özcan S. , Taşdemir Z. , Gürgan C. A. Tübitak Projesi, 2017 – 2020
  3. Tgf-ß1 İle Transfekte Edilmiş Pulpal Kök Hücre Ve Prp Uygulamasının Kondrojenik Diferensiasyon Üzerine Etkileri Kütük N. (Yürütücü) , Alkan A. , Özcan S. , Salkın H. Tübitak 1002 Projesi, 2014 -2016
  4. Temporomandibuler Eklemde Deneysel Olarak Oluşturulmuş Osteoartritte Kök Hücre Ve Plateletten Zengin Plazmanın (Prp) Fibrokartilaj Ve Kemik Tamiri Üzerine Etkilerinin Araştırılması Kütük N. (Yürütücü), Özcan S., Özdamar S., Alkan A., Gönen Z. B. , Salkın H., Et Al. Tübitak 1001 Projesi, 2014 – 2016
  5. Senesent Mezenkimal Kök Hücre Sekretomunun Kanser Hücre Hatları Üzerine Biyolojik Etkilerinin Değerlendirilmesi Gönen Z. B. (Yürütücü), Özcan S. Tübitak Projesi, 2014 – 2016
  6. Fare Adipoz Doku Kök Hücre Popülasyonunda Obezite Ve Pluripotensi İlişkisinin Değerlendirilmesi Özcan S. (Yürütücü) , Al- Sammarraıe S. H. A. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2019 – 2020
  7. Mkh Muse Ve İps (Epizomal Geri Programlanmış) Hücrelerinin Genotoksik Stres Direncinin Shotgun Proteomik Metotlarla İncelenmesi Özcan S. (Yürütücü), Acar M. B. , Özkul Y. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2018 – 2020
  8. Türkiyede Yayılış Gösteren Crocidura Cinsinin (Soricomorpha Mammalia) Komple Mitokondriyal Genomunun Yeni Nesil Dna Dizileme Teknolojisi İle Dizilenmesi Ve Filogenetik Analizi Tez C. (Yürütücü) , Özcan S. , İbiş O. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2017 – 2019
  9. Metformin Uygulamasının Replikatif Senesent İnsan Mezenkimal Kök Hücrelere Etkisinin Gen İfadesi Düzeyinde İncelenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Galderisi U. , Mert E. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2017 – 2018
  10. Multipotent Stromal Hücreler Üzerine Metforminin Etkilerinin Analizi Özcan S. (Yürütücü) , Ömerli F. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2017 – 2018
  11. Obez Ve Obez Olmayan Fare Modellerinde Adipoz Doku Orjinli Mezenkimal Kök Hücrelerin Senesense Olan Yatkınlıklarının Belirlenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Murat A. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2017 – 2018
  12. Alfa/Beta T Hücre Azaltılmış, Gama/Delta T Hücre Ve Nk Hücre Zenginleştirilmiş Donör Lenfosit İnfüzyonu Karakükcü M. (Yürütücü),  Kaynar L., Ünal E. , Özcan S. Tübitak 1003 Projesi, 2014 – 2017
  13. İç Anadolu Bölgesi’nde Yeni Nesil Sekanslama Teknolojisiyle Kalıtsal Tek Gen Hastalıklarının Tespiti Özkul Y. (Yürütücü) , Özcan S. , Öztürk A. R. , Zararsız G. , Gönen Z. B. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2014 – 2017
  14. Achillea Millefolium’un Çeşitli Yöntemler Kullanılarak Bazı Hücre Hatları Üzerine Apoptotik/Mitotik Etkisinin Araştırılması Özcan S. (Yürütücü) , Karadaş E. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2012 – 2017
  15. Genç Ve Senesent Mkh Sekretomlarının Kanser Hücre Hatlarına Etkilerinin İncelenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Acar M. B. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2015 – 2016
  16. Mitokondriyal Ve Nüklear Dna Dizileri Kullanılarak Türkiyede Yayılış Gösteren Cricetulus Migratorius (Mammalia: Rodentia) Türünün Filogenetik Analizi Tez C. (Yürütücü) , Özcan S. , İbiş O., Kılıç M. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2011 – 2014
  17. Erciyes Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma Ve Uygulama Merkezi (Erbiotek) Güdümlü Projesi Özkul Y. (Yürütücü) , Özcan S. , Saatçi E. , Bolak Hisarlıgil B.Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2011 – 2014
  18. Türkiye’deki Echinops L. (Asteraceae) Cinsi Taksonlarının Nüklear Ribosomal Dna Ve Kloroplast Dna Dizileri Kullanarak Filogenetik Analizi Ve Dna Barkodlaması Vural C. (Yürütücü) , Özcan S. , Şapçı H., Güçlü G. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2011 – 2014
  19. Farklı İrrigasyon Rejimlerinin Kök Kanallarındaki E.Faecalis Üzerine Etkinliğinin Değerlendirilmesi Er Ö. (Yürütücü) , Demirbuğa S. , Tuncay Ö. , Dinç G. , Özcan S. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2012 – 2014
  • Alveoler Yarıkların Onarımında Kök Hücre Uygulamaları: Deneysel Çalışma Alkan B. A. (Yürütücü) , Alkan A. , Gönen Z. B. , Ekizer A., Özcan S. , Özkul Y. , Et Al. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2012 – 2014
  1. İnsan Mezenkimal Kök Hücrelerinin Kanser Kök Hücrelerine Dönüşümünde Piwil2’nin Rolü Özcan S. (Yürütücü) , Şahin F. S. , Ünal A. , Canöz Ö. , Dinç G. , Şıvgın S., Et Al. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2011 – 2013
  2. İnsan Meme Epitel Hücrelerinin, Göğüs Kanseri Kök Hücrelerine Transisyonunda Piwil2 Rolünün Araştırılması Dinç G. (Yürütücü) , Özbilge H., Ekizer A., Özcan S. , Özkul Y. , Çetin M. , Et Al. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2011 – 2013
  3. Nac (Nasetil Sistein) Uygulamasının Mezenkimal Kök Hücre Senesensi Üzerindeki Etkisinin İncelenmesi. Özcan S. (Yürütücü) , Bolat M. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  4. Nac Nasetilsistein Uygulanmış Fare Modelinde Eklem Bağ Doku Fibroblastlarının Senesens Apoptoz Durumlarının Değerlendirilmesi Özcan S. (Yürütücü) , Bozalan H. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  5. Nac N -Asetil Sistein Kullanan Ve Kullanmayan Fare Modelinde Adipoz Doku Orijinli Mezenkimal Kök Hücrelerin Senesense Olan Yatkınlıklarının Belirlenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Günaydın Z. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  6. Türkiye Ağaç Sincaplarının (Sciurus: Sciuridae: Rodentia: Mammalia) Komple Mitogenomunun Karakterizasyonu Ve Filogenisi Tez C. (Yürütücü) , Özcan S. , Selçuk A. Y. , Baran M. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  7. Tegdma’nın Sağlıklı Ve İnflame Pulpa Kaynaklı Kök Hücreleri Üzerine Sitotoksik Etkisinin İncelenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Durukan S. M. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  8. İmmün Hücrelerin Mcf-7 Hücre Hattı Plurıpotent Alt Gruplarına Etkisinin İncelenmesi Özcan S. (Yürütücü) , Şimşek A. Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
Birim Yayınlar

Uluslararası Hakemli Dergilerde Yayımlanan Makaleler:

  1. Acar M. B., Aprile D., Ayaz Güner Ş., Güner H., Tez C., Di Bernardo G., Peluso G., Özcan S., Galderisi U., (2021). Why Do Muse Stem Cells Present An Enduring Stress Capacity? Hints From A Comparative Proteome Analysis.  Internatıonal Journal Of Molecular Scıences 10.3390/İjms22042064
  2. Gul A., Kurt G., Karsli E., Ozcan S., Acar M., Amuk M., Lekesizcan A., Gurgan C., (2020). Effects Of Mesenchymal Stem Cell Transfer On Orthodontically İnduced Root Resorption And Orthodontic Tooth Movement During Orthodontic Arch Expansion Protocols: An Experimental Study İn Rats. European Journal Of Orthodontics 10.1093/Ejo/Cjz035
  3. Acar, M. B., Ayaz-Guner S., Di Bernardo, G., Guner, H., Murat, A., Peluso, G., Ozcan S., Galderisi, U. (2020). Obesity İnduced By High-Fat Diet İs Associated With Critical Changes İn Biological And Molecular Functions Of Mesenchymal Stromal Cells Present İn Visceral Adipose Tissue. Agıng. Doı: 18632/Aging.202423
  4. İçöz K., Eken A., Cinar S., Murat A., Özcan S., Ünal E. (2020). Immunomagnetic Separation Of B Type Acute Lymphoblastic Leukemia Cells From Bone Marrow With Flow Cytometry Validation And Microfluidic Chip Measurement. Et Al. Separatıon Scıence And Technology. Doı: 10.1080/01496395.2020.1835983.
  5. Acar, M. B., İbiş, E. K., Şimşek, A., Vural, C., Tez, C.,Özcan, S. (2020). Evaluation Of Achillea Millefolium Essential Oil Compounds And Biological Effects On Cervix Cancer Hela Cell Line. The Eurobiotech Journal, 4(1), 17-24. Doı: 10.2478/Ebtj-2020-0003
  6. Alessio, N., Acar, M. B., Demirsoy, I. H., Squillaro, T., Siniscalco, D., Di Bernardo, G., Özcan, S., Galderisi, U. (2020). Obesity İs Associated With Senescence Of Mesenchymal Stromal Cells Derived From Bone Marrow, Subcutaneous And Visceral Fat Of Young Mice. Aging (Albany Ny), 12(13), 12609. Doı: 10.18632 / Agıng.103606.
  7. Ünsaldı, E., Kurt-Kızıldoğan, A., Özcan, S., Becher, D., Voigt, B., Aktaş, C., Özcengiz, G. (2020). Proteomic Analysis Of A Hom-Disrupted, Cephamycin C Overproducing Streptomyces Clavuligerus. Protein And Peptide Letters. Doı: 10.2174/0929866527666200723163655
  8. Ayaz-Guner S., Alessio N., Acar M., Aprile D., Özcan S., Di B. (2020). A Comparative Study On Normal And Obese Mice İndicates That The Secretome Of Mesenchymal Stromal Cells İs İnfluenced By Tissue Environment And Physiopathological Conditions. Cell Communication And Signaling: Ccs, Cilt.18, Ss.118. Doı: 10.21203 / Rs.3.Rs-23977 / V1
  9. İbiş, Osman, Biş O., Selçuk A. Y., Sacks B. N., Yıldız B., Özcan S., Kefelioğlu H. (2020). Whole Mitochondrial Genome Of Long-Clawed Mole Vole (Prometheomys Schaposchnikowi) From Turkey, With İts Phylogenetic Relationships. Genomıcs, Cilt.112, Ss.3247-3255, Et Al. Doı: 10.1016/J.Ygeno.2020.06.008
  10. Gul A., Kurt G., Karsli E., Ozcan S., Acar M., Amuk M., Lekesizcan A., Gurgan C. Effects Of Mesenchymal Stem Cell Transfer On Orthodontically İnduced Root Resorption And Orthodontic Tooth Movement During Orthodontic Arch Expansion Protocols: An Experimental Study İn Rats. European Journal Of Orthodontics, Volume 42, Issue 3, June 2020, Pages 305–316, 2020. Doı: 10.1093/Ejo/Cjz035
  11. Fayemi P. O., Ozturk I., Kaan D., Özcan S., Yerer M. B., Dokumaci A. H., Özcan C., Uwaya G. E., Fayemi O. E., Yetim H. (2019). Bioactivities Of Phytochemicals İn Callistemon Citrinus Against Multi-Resistant Foodborne Pathogens, Alpha Glucosidase İnhibition And Mcf-7 Cancer Cell Line Bıotechnology & Bıotechnologıcal Equıpment, Cilt.33, Ss.764-778. Doı: 10.1080/13102818.2019.1616615
  12. Telcioğlu M., İbiş O., Aksöyek E., Özcan S., Moradi M., Gürkan Ö. F., Tez C. (2019). Genetic Analysis Of Iranian And Turkish Red Foxes (Vulpes Vulpes) Based On Mitochondrial Dna (D-Loop) Sequences Ethology Ecology & Evolutıon, Cilt.31, Ss.568-582. Doı: 10.1080/03949370.2019.1639079
  13. İbiş O., Özcan S., Kırmanoğlu C., Keten A., Tez C. (2019). Genetic Analysis Of Turkish Lynx (Lynx Lynx) Based On Mitochondrial Dna Sequences Russian Journal Of Genetics, Cilt.55, Ss.1426-1437.
  14. Salkın H., Gönen Z., Özcan S., Bahar D., Lekesizcan A., Taheri S., Kütük N., Alkan A. (2019). Effects Of Combination Tgf-B1 Transfection And Platelet Rich Plasma (Prp) On Three-Dimension Chondrogenic Differentiation Of Rabbit Dental Pulp-Derived Mesenchymal Stem Cells. Connective Tissue Research, Ss.1-12, Doı: 10.1080/03008207.2019.1675649
  15. Telcioğlu M., İbiş O., Aksöyek E., Özcan S., Moradi M., Gürkan Ö. F., Tez C. Genetic Analysis Of Iranian And Turkish Red Foxes (Vulpes Vulpes) Based On Mitochondrial Dna (D-Loop) Sequences. Ethology Ecology & Evolutıon, Cilt.31, Ss.568-582, 2019. Doı: 10.1080/03949370.2019.1639079
  16. İçöz K., Gercek T., Murat A., Özcan S., Ünal E. (2018). Capturing B Type Acute Lymphoblastic Leukemia Cells Using Two Types Of Antibodies Bıotechnology Progress, Cilt.35. Doı: 10.1002/Btpr.2737
  17. Alessio, N., Squillaro, T., Özcan, S., Di Bernardo, G., Venditti, M., Melone, M., Peluso, G., Galderisi, U. Stress And Stem Cells: Adult Muse Cells Tolerate Extensive Genotoxic Stimuli Better Than Mesenchymal Stromal Cells. 2018. Oncotarget: 9(27), Pp. 19328-19341. Doı: 10.18632/Oncotarget.25039.
  18. İbiş O, Koepfli K-P, Özcan S, Tez C. Genetic Analysis Of Turkish Martens: Do Two Species Of The Genus Martes Occur İn Anatolia? 2018. Zool. Scr:00:1–14. Doı: 10.1111/Zsc.12289.
  19. Ercan, F., Baş, H., Ercan, N., Vural, C., Özcan, S. (2018). Fumigant Toxicity Of Essential Oils From Thymus Argues Boissier Balansa And Thymus Sipyleus Boissier (Lamiaceae) Against Ephestia Kuehniella Zeller (Lepidoptera: Pyralidae). International Journal Of Scientific And Technological Research: 4(3), Pp.54-60.
  • İçöz, K., Gerçek, T., Murat, A., Özcan, S., & Ünal, E. (2018). Capturing B Type Acute Lymphoblastic Leukemia Cells Using Two Types Of Antibodies. Biotechnology. Doı 10.1002/Btpr.2737.
  1. Squillaro T., Alessio N., Di Bernardo G., Özcan S., Peluso G., Galderisi U. (2018). Stem Cells And Dna Repair Capacity: Muse Stem Cells Are Among The Best Performers. In: Dezawa M. (Eds) Muse Cells. Advances İn Experimental Medicine And Biology, Vol 1103. Springer, Tokyo, Part Of Springer Nature. Chp: V. Pp 103-113. Print Isbn 978-4-431-56845-2, Online Ebook Isbn 978-4-431-56847-6 (2018) Isbn: 978-4-431-56847-6. Doı/10.1007/978-4-431-56847-6_5
  2. İbiş O., Kılıç M., Özcan S., Tez C. Genetic Characterization Of The Turkish Grayhamster (Cricetulus Migratorius) Based On Mitochondrial Cytochrome B And 12s Rrna Sequences. Mitochondrial Dna Part A, 2018. 29:(6) 819-830. Doı: 10.1080/24701394.2017.1365849
  3. Alessio N., Özcan S., Tatsumi K., Murat A., Peluso G., Dezawa M., Galderisi U. The Secretome Of Muse Cells Contains Factors That May Play A Role İn Regulation Of Stemness, Apoptosis And İmmunomodulation. Cell Cycle 2017; 16(1): 33-44. Doı: 10.1080/15384101.2016.1211215.
  4. Aksöyek E., İbiş O., Özcan S., Moradi. M., Tez C. Dna Barcoding Of Three Species (Canis Aureus, Canis Lupus And Vulpes Vulpes) Of Canidae. Mitochondrial Dna Part A. 2017: 28:(5) 747–755. Doı: 10.1080/24701394.2016.1180512.
  5. Sapcı H., Vural C, Özcan S. (2017). Antimicrobial And Antioxidant Activity Of Echinops Emiliae (Asteraceae). International Journal Of Secondary Metabolite, Vol. 4: 3, Pp. 400-405
  • Özcan S., Alessio N., Acar M.B., Mert E., Omerli F., Peluso G., Galderisi U. Unbiased Analysis Of Senescence Associated Secretory Phenotype (Sasp) To İdentify Common Components Following Different Genotoxic Stresses. Aging Us. Vol. 8, Pp.1316-1329, 2016; Doı: 10.18632/Aging.100971.
  1. İbiş O., Aksöyek E., Özcan S., Keten A., Yorulmaz T., Tez C. Genetic Analysis Of The Turkish Gray Wolf (Canis Lupus) Based On Partial Mitochondrial Dna Sequences. Vertebrate Zoology. 2016; 66(3): 427-435.
  • Özcan, S., Alessio, N., Acar, M. B., Toprak, G., Gönen, Z. B., Peluso, G., Galderisi, U. Myeloma Cells Can Corrupt Senescent Mesenchymal Stromal Cells And İmpair Their Anti-Tumor Activity. Oncotarget. 6(37): 39482-39492. 2015; Doı: 10.18632/Oncotarget.5430.
  • İbiş O., Tez C., Özcan S., Yorulmaz T., Kaya A., Mohradi M. Insights İnto The Turkish And Iranian Badgers (The Genus Meles) Based On The Mitochondrial Cytochrome B Gene Sequences. Vertebrate Zoology. Vol. 65, Pp.399-407, 2015.
  1. İbiş O., Aksöyek E., Özcan S., Tez C. A Preliminary Phylogenetic Analysis Of Golden Jackals (Canis Aureus) (Canidae: Carnivora: Mammalia) From Turkey Based On Mitochondrial D-Loop Sequences. Vertebrate Zoology. Vol. 65, Pp.391-397, 2015.
  2. İbiş O., Tez C., Özcan S., Phylogenetic Status Of The Turkish Red Fox (Vulpes Vulpes), Based On Partial Sequences Of The Mitochondrial Cytochrome B Gene, Vertebrate Zoology. 2014, 64(2): 273-284.

 

Uluslararası Bilimsel Toplantılarda Sunulan Ve Bildiri Kitabında Özeti Basılan Bildiriler:
  1. Gül Amuk, N., Gürcan, C.A., Taşdemir, Z., Özcan, S., Amuk, M., Kurt, G. Dehisens Tedavisinde Kollajen Aracılığıyla Mezenkimal Kök Hücre Aktarımının Etkinliği: Sıçanlarda Mikrobt Ve Transkripsiyonel Değişim İncelemesi. Et Al. Erdiş Diş Hekimliği Kongresi, Kayseri, Türkiye, 26 -29 Şubat 2020
  2. Murat A., Ayaz-Guner S., Acar M. B., Mert Gökduman E., Dinç G., Ulu Kılıç A., Doğanay M., Özcan S. Immunoproteomıc Analysıs Of Acınetobacter Baumannıı Surface And Secreted Proteıns 7th International Congress Of The Molecular Biology Association Of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27- 29 September 2019, Ss.192
  3. Ayaz-Guner S., Acar M. B., Mert Gökduman E., Alessıo N., Galderısı U., Özcan S. Contact Wıth Senescent Mesenchymal Stem Cells (Mscs) Modulate Secretome Composition Of Myeloma Cells 7th International Congress Of The Molecular Biology Association Of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27- 29 September 2019, Ss.194
  4. Dinç G, Ulu Kılıç A, Mert Gökduman E, Acar M. B, Murat A, Ömerli F, Özcan S, Doğanay M. An Investigation Of Protective Immunogenic Proteins Of Acinetobacter Baumannii With Immunoproteomic Analysis. 16th Medical Biodefence Conference, 28-31 October 2018, Münih, Germany, Pp….
  5. Uzun A., Yılmaz S., Özcan S., Gürcan K., Pınar H., Gülşen O. Peptide Difference İn Seedy And Seedless Lemon Cultivars Current Trends İn Natrural Sciences, 19 – 21 April 2018
  6. Dinç G., Ulu Kılıç A., Mert Gökduman E., Acar M. B., Murat A., Ömerli F., Özcan S., Doğanay M. An Investıgatıon Of Protectıve Immunogenıc Proteıns Of Acınetobacter Baumannıı Wıth Immunoproteomıc Analysıs 16th Medical Biodefence Conferance, 28 – 31 October 2018, Ss.30
  7. İbiş O., Naji A.Q., Moradi M., Özcan S., Tez C. “Genetic Analysis Of Brown Hare Populations From Iran And Iraq Based On Mitochondrial Coxı Sequences”, Ecology 2017, Kayseri, Türkıye, 11-13 Mayıs 2017, Pp.169-169. Oral Presentation.
  8. Uzun A., Yılmaz S., Özcan S., Gürcan K., Pınar H., Gülşen O. ”Protein Profiles Of Seedy And Mutant Seedless Lemon Cultivars”, The 3rd International Symposium On Euroasian Biodiversity 2017, Mınsk, Belarus, 05-08 July 2017, Pp. 108, Op200.
  9. İşlerel, Tekin, E. And Özcengiz, G., Özcan, S. Dynamic Comparative Secretome Analysis Of Bacillus Subtilis Standard Strain And İts Bacilysin-Deleted Mutant. “19th Intern. Conf. On Bacilli And Gram-Positive Bacteria (11-15 June 2017, Berlin). Gpc_Abstractbook”, (2017), P.P 94.
  10. Özcan S., “Negative Effects Of Myeloma Cells On Senescent Mesenchymal Stromal Cells Anti-Tumour Paracrine Activity”, 6. Multidisipliner Kanser Araştırma Kongresi, Konya, Türkıye, 27-30 Ekim 2016, Pp.77-77. Sözlü Sunu.
  11. Ozcan, S., Acar, M. B., Alessio, N., Galderisi, U., Toprak, G., Ozturk, A.R., Otto, A., Gonen. Z.B. Secretome Of Naïve Senescent Mesenchymal Stromal Cell Promotes Senescence İn Arh-77 Myeloma Cells, This Effect İs Dampened By Cancer-Priming Of Mscs. A Proteome Analysis Of Changes İn Secretome Composition. 14th Human Proteome Organization World Congres (Hupo); 27- 30th September, 2015, Pp161 (P06.51) Vancouver, Canada.
  12. Ozcan, S., Toprak, G., Büttner, K., Becher, D., Otto, A., Özcengiz, G., Özcengiz, E., Acar, M. B. Immunoproteome Analysis Of Bordetella Bronchiseptica By Ip- Nlc-Ms/Ms. 14th Human Proteome Organization World Congres (Hupo); 27 – 30th September, 2015, Pp192 (P09.21), Vancouver, Canada.
  13. Alkan A., Gönen Z. B., Ekizer A., Özcan S., Taheri S., Sönmez M. F., Özkul Y., “Repair Of Alveolar Clefts Through Dental Pulp Derived Mesenchymal Stem Cell Application: An Experimental Study”, Acbid 2014 8. International Congress, Op-28, May 28th June1st, 2014. Antalya Turkey.
  14. Ünsaldı, E. And Özcengiz, G., Özcan, S. Differential Proteomics Of Wild Type And Engineered Strains Of Streptomyces Clavuligerus-Invited Talk İn Xvıı. International Symposium On The Biology Of Actinomycetes (Isba17; 8-12 October 2014, Kuşadası). “Book Of Abstracts (Isbn 978-605-65121-0-0)”, (2014), P.109.
  15. Özcan, S., Toprak, G., Bütner, K., Becher, D., Özcengiz, G., Özcengiz, E. Proteomic Charecterization Of Antigenic Proteins İn Bordetella Bronchiseptica. 10th International Symposium On Bordetella, Sep 8-11th 2013, Pp99. Trinity Biomedical Sciences Institute, Dublin, Ireland.

 

Yazılan Uluslararası Kitaplar Veya Kitaplarda Bölümler:
  1. Muse Cells Squillaro T., Alessio N., Bernardo G. D., Özcan S., Peluso G., Galderisi U., Dezawa M. Stem Cells And Dna Repair Capacity: Muse Stem Cells Are Among The Best Performers., Mari Dezawa, Editör, Springer, London/Berlin, Tokyo, Ss.103-113, 2018
  2. Muse Cells:Endogenous Reparative Pluripotent Stem Cells Squillaro T., Alessio N., Di Bernardo G., Özcan S., Peluso G., Galderisi U. Stem Cells And Dna Repair Capacity:Muse Stem Cells Are Among The Best Performers, Dezawa, Mari, Editör, Springer Japan Kk, Part Of Springer Nature, Ss.103-113, 2018
    Ulusal Hakemli Dergilerde Yayımlanan Makaleler:

    Özcan S., Alessio N., Acar M. B., Di Bernardo G., Melone M. A. B., Peluso G., Galderisi U. Filamin B And Cd13 Are Components Of Senescent Secretomes That May Be Involved İn Primary (Stress Induced) And Paracrine Senescence Of Mesenchymal Stromal Cell Squillaro Ercıyes Medıcal Journal, Cilt.41, Ss.135-140, 2019 (Escı İndekslerine Giren Dergi)

Araştırma Grubunun İş Birlikleri: (Üniversite, Sanayi, Uluslararası vb.)
  1. Dr. Umberto GALDERİSİ, Professor of Molecular Biology at the School of Medicine, University of Campania “Luigi Vanvitelli”, Naples, Italy.
  2. Şerife AYAZ GÜNER, İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü/Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı
  3. Nicola ALESSİO Assistant Professor of Molecular Biology at the School of Medicine, University of Campania “Luigi Vanvitelli”, Naples, Italy.
  4. Volkan Yıldırım, Atatürk Üniversitesi Doğu Anadolu Yüksek Teknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi
  5. Uzman Hüseyin GÜNER, Abdullah Gül Üniversitesi Yaşam Ve Doğa Bilimleri Fakültesi Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı